Внесен, но негистриран навреме капитал в ТР

Здравейте,
Имам следния казус :При заверяването на ГФО от одитор, се оказа, че регистрирания капитал в ТР, се отличава от внесения такъв в ООД и просто не е отразено в регистъра. И така години наред,
напускат счетоводител след счетоводител и никой не поправя това обстоятелство. И без да съм счетоводител в това ООД , изпълнявам съвсем друга длъжност, /но имам дълъг стаж като счетоводител/, на мен се падна тази "чест" да оправям бъркотията. Подготвих всички платежни за вноските на съдружниците, решения от ОС, начални баланси при учредяването на ООД, баланси към 31.12. на ООД, тъй като един от съдружниците участва като физ.лице с ЕООД и съдружието му е натрупаната в резерв печалба в ЕООД-то, и сега какво  по- нататък???  Как ще се оправи бъркотията с капитала, като са минали години/да не казвам колко за срам/