Мисля , че всичко е наред както сте го описали.
Вие от Ваша страна осъществявате ВОП - стоката се транспортира от една страна членка до друга. Предполагам сте и регистрирани по ЗДДС . Съставяте си протокол за самоначисляване на ддс по чл.117 , имате фактура от гръцкия Ви доставчик и транспортен документ , че стоката действително е пристигнала на наша територия.
От друга страна Вие вече като собственик на стоката предмет на ВОП , извършвате продажна на чат от тея на наша територия . Издавате си фактура с начислено 20% ддс на българския Ви контрагент , като му предоставяте и копие на транспортните документи с цел доказване на направените и платени от Вас разходи , който включвате в надценката.