След като сканирате всички документи /след полагане на подписите, печатите и т.н./ и е възможно да ги възпроизведете не виждам никакъв проблем да унищожите хартиения носител т.к. ще покривате изискванията на чл. 42 от ЗСч:
Чл. 42. (1) (Изм. - ДВ, бр. 57 от 2007 г.) Счетоводната информация се съхранява в предприятието по реда, предвиден в Закона за Националния архивен фонд, в следните срокове:
1. ведомости за заплати - 50 г.;
(2) (Изм. - ДВ, бр. 94 от 2010 г., в сила от 1.01.2011 г.) Счетоводната информация може да се съхранява на хартиен или на технически носител и в архиви, организирани от друго предприятие с такъв предмет на дейност, при спазване на изискванията по ал. 1.
(3) (Доп. - ДВ, бр. 105 от 2006 г.) След записване (пренасяне) на счетоводната информация от хартиен върху магнитен, оптичен или друг технически носител, осигуряващ надеждното й възпроизвеждане, хартиеният носител може да се унищожи. Пренесената на технически носител счетоводна информация трябва да може да бъде възпроизведена в обем и съдържание, идентични с информацията, съдържаща се на хартиения носител.
(4) (Нова - ДВ, бр. 105 от 2006 г.) Когато предприятие се прекратява чрез преобразуване, носителите (хартиени и/или технически) на счетоводна информация се предават на приемащото и/или новоучреденото предприятие/ предприятия.
Само да отбележа, че това си е нож с 2 остриета ако ще ги съхранявате по флашки, сидита, а нямате специализиран сървар за съхранение на съответната информация т.к. верояността да се затрие от някой неразбиращ е голяма.