В протокола вписвате цената, която смятате, че Ви устройва. Добре е да е съобразена с пазарната, т.е. за колко бихте ги продали на друго (несвързоно) лице. Не е нужна нотариална заверка.
За ДДСто - според степента на амортизация. Вижте закона или изчакайте по-компетентно мнение