Съкращение на служител с Диабет и създаване на работно място на граждански договор за същата позиция

Няма начин да "се създава работно място на граждански договор". При граждански договор няма работно място. Няма и "позиция"/длъжност.
Какво да предприема? Опасявам се, че нищо.
Ако имате време за губене и излишни нерви, можете да подадете оплакване в Инспекцията по труда или да заведете съдебно дело.

искат от мен да водя колегата и да му прехвърлям клиенти. Това какво означава?

Зависи и от основанието за съкращение. Щом се иска разрешение от ИТ, то се очаква да е поради закривате на щата, намаляване обема на работа, при липса на качества на работника или служителя за ефективно изпълнение на работата или при промяна на изискванията за изпълнение на длъжността, ако работникът или служителят не отговаря на тях. В последните два случая на работното място веднага може да бъде назначен друг.
Забавянето на съкращението може да не е поради очакване решение от ИТ, а просто да се търси друг вариант, при който прекратяването на договора не изиска разрешение.

Граждански договор с работно място и работно време е прикрит трудов договор. Работодателят нарушава чл. 61, ал. 1 - допускане на работа без трудов договор.

КТ
чл. 414 (3) Работодател, който наруши разпоредбите на чл. 61, ал. 1, чл. 62, ал. 1 или 3 и чл. 63, ал. 1 или 2, се наказва с имуществена санкция или глоба в размер от 1500 до 15 000 лв., а виновното длъжностно лице - с глоба в размер от 1000 до 10 000 лв., за всяко отделно нарушение.

След като се убедите, че наистина работата се върши без трудов договор, можете да подадете сигнал в ИТ. Нищо няма да спечелите, но ще имате повод за злорадстване.

Право на подбор
Чл. 329. (1)  При закриване на част от предприятието, както и при съкращаване в щата или намаляване на обема на работата, работодателят има право на подбор и може в интерес на производството или службата да уволни работници и служители, длъжностите на които не се съкращават, за да останат на работа тези, които имат по-висока квалификация и работят по-добре.

Извинявам се. Нищо лично. Само цитирам КТ.
За да поиска разрешение от ИТ работодателят трябва да се мотивира защо ще съкрати именно Вас, а не колегата Ви. 
Ако и колегата Ви е съкратен, а после назначен отново и на Вашето място, можете да подадете жалба в ИТ. Не зная дали ще има полза, но и вреда няма да има.
За "назначаването" по ГД са Ви казали