Малко неясно сте описали ситуацията - да видим дали правилно съм я разбрала:
1. Вие извършвате ВОДСтоки за Румъния и сте наели превозвач за транспорта.
2. Вашият клиент си удържа стойността на липсваща стока по доставката от цената на превоза.
3. Превозвачът изисква от Вас фактура за стоката (ама с какви аргументи в посока издаване на фактура - просто недоумявам
)
4. Някой е откраднал част от стоката - кой и по време на превоза, или преди това и тя не е натоварена, или след това и тя е разтоварена, но е открадната от клиента и как това е документирано?!?