Мисля, че грешката е очевидна и регистрация по ДДС е нонсенс.
Само не ми стана ясно - издал е грешен КБ, издал е и сторно - това сторно от кочан ли е или в новите КА? Ако е от кочан мисля, че оборота в КА си остава, в книгата ще запишете големия оборот с милиона, както е излязал на отчета, после ше запишете и сторното за милиона и финално в книгата нещата ще се нормализират. Ако е с новите касови апарати - не знам как е, още нямам такъв.
Това, че служебно е извадил от касовия апарат стойността на сгрешената сума мисля, че е правилно, по такъв начин е намалил наличието в касата. Но това служебно въвеждане и извеждане на суми не се отразява на оборота, а само на наличността.