При нас редовно имаме такава ситуация. Правя фактура за аванса - не я изпращам на клиента, фактурата е само за нашето счетоводство. При изпращане на стоката: правя фактура за митница със цялата сделка, без да включвам аванса. След като стоката замине, коригирам фактурата, като на отделен ред със знак минус нанасям аванса. Разпечатвам си фактурата на български - с аванса, а на английски - без аванса.