Доколкото във фактурите няма задължителен реквизит за начина на плащане, то е без значение какво ще пише. А и да пише нещо, едва ли ще върнете парите, платени по друг начин
Трябва да видите дали отбелязването на начина на плащане се отразява нататък - в счетоводната програма (ако са обвързани фактуриращата и счетоводната) или примерно към касовия апарат - за издаване на КБ при плащане на ПОС.
Също да прецените дали отбелязването на начина на плащане ви помага в работата - селектиране на фактурите, следене на плащанията и т.н. Ако това е важно вероятно трябва да се направи някаква доработка на фактуриращата програма.