Новоучредена фирма по ДДС е взимала фактури преди започване на осигуряване

Осчетоводени ги. По няколко причини:
- тези материали , стоки и активи ще участват в понататъшния оборот
- системата на НАП засича издадените към лицето и невключени в дневниците  фактури
- грешките в осигуряването не бива да водят и до грешки в счетоводството.
Колкото до късно подадената ОКД5: вероятно ще е проблем. Добрата новина е, че може да се установи само при проверка - при болнични, покрай друга проверка, случайно..., Лошата е, че като се открие грешката следват глоби, лихви, начисления със задна дата.

а при проверка за възстановяване на ДДС би ли било проблем според Вас

Ако наречем проблем, че може да установят този пропуск и да ви поискат да коригирате осигуряването - да, но това не е пречка да си възстановите ДДС-то .