"Правилно ли е доставчик при грешно издадена фактура , да я "анулира" чрез кредитно известие за същата стойност и количества"
Не е правилно, но е много масова практика.
"Трябва ли контрагента към който са издадени тези фактура , Ки и новата фактура да ги включва в дневника си за покупки всички ?"
Да, трябва.
"А НАП ми търсят само защо не сме включили съответните КИ .... за първите грешни фактури нищо не питат"
Питат за КИ , защото то намалява данъчния кредит и невключването му ощетява бюджета. Освен това е действие, за което е предвидена глоба. Виждаме на практика приложение на принципа, че ако фирмата се ощети от неползван ДК не е нищо особено, но за бюджета - това е "друга работа".