Отписване на актив, който не е напълно амортизиран.

Предполагам, че ще се бракува?
241/20 -  натрупаната амортизация
609/20 -  балансовата стойност
498/709 - върнатата сума

Счетоводните амортизации за годината и счетоводната балансова стойност се посочват в увеличение на финансовия резултат, а данъчните амортизации и данъчната стойност - в намаление.

При комп. в гаранция, според Вас какво са променили и при положение, че бройката е една?

Получено ДКИ на сума 5750 +1150 ДДС
Начислени амортизации до момента :2156.22
Балансова стойност : 31593.78

 Доставчикът издава ДКИ и връща  цялата сума.

Доставчикът е възстановил сумата с ДДС, т.е 6900 лв.
Това правилно ли е? 

Това не се коректни счетоводни записвания. По-скоро при получаване на кредитно ще има:
Д-т с/ка 241 - с натрупаната амортизация
       К-т с/ка 709 - с разликата
       К-т с/ка 204 - с балансовата ст-ст
По с/ка 401 ще остане салдо.