Сметка 499 - Външни кредитори

Чисти се с метла, парцал или други такива

Извън шегата - "чистенето" зависи от това, на какво основание сте захранвали сметката през годините.
Като превеждам по банков път суми от фирмата към себе си ли? - добър вариант, но и това трябва да е съобразено с основанието за захранване.
Дължа ли данъци като го правя така? - зависи от основанието на вноските, с които е захранвана сметката.
Счетоводителят Ви не Ви ли обясни вече нещата, та пак питате?

.Счетоводителката ми твърди, че ги е водила като РАЗЧЕТИ СЪС СОБСТВЕНИКА. 

Това беше очевидно. Не е ясно какво е основанието за внасянето на тези средства

.Означава ли това, че просто мога да превеждам от Фирмената към личната ми сметка 

Казах Ви: зависи. Информацията не е достатъчна

.ТЯ ТВЪРДЕ, ЧЕ Е Така се чисти.

Възможно е. Тя със сигурност знае неща, които ние не знаем

.КАКВО МИСЛИТЕ?

Лично аз си мисля за няколко неща: Или се губи комуникацията Ви със счетоводителката, или не й вярвате, или не й плащате.